1 रिपॉजिटरी
Awesome GitHub RepositoriesMolecular Structure Export
Export of 3D molecular structures to formats like PDB with specific residue or atom filtering.
Distinct from Structured Data Exporters: Focuses on 3D atomic coordinate data rather than general JSON/CSV document exports.
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Awesome Molecular Structure Export GitHub Repositories
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- biopython/biopython
biopython/biopython
5,078GitHub पर देखेंBiopython पायथन के लिए एक बायोइनफॉरमैटिक्स लाइब्रेरी है जो जैविक अनुक्रमों, आणविक संरचनाओं और फाइलोजेनेटिक पेड़ों को पार्स, मैनिपुलेट और विश्लेषण करने के लिए टूल्स प्रदान करती है। यह कई उद्योग-मानक फ़ाइल फॉर्मेट्स में जीनोमिक और प्रोटिओमिक डेटा के लिए एक जैविक अनुक्रम पार्सर के रूप में कार्य करती है और NCBI Entrez रिपॉजिटरी से जैविक डेटा और उद्धरणों को क्वेरी करने के लिए एक इंटरफेस के रूप में कार्य करती है। यह प्रोजेक्ट प्रोटीन संरचना विश्लेषण और फाइलोजेनेटिक ट्री निर्माण के लिए विशेष टूलकिट्स के माध्यम से खुद को अलग करता है। इसमें आणविक ज्यामिति की गणना करने के लिए PDB और mmCIF फ़ाइलों को प्रोसेस करने के लिए एक प्रोटीन संरचना एनालाइज़र, और प्रजातियों के बीच विकासवादी संबंधों का विश्लेषण करने के लिए एक फाइलोजेनेटिक ट्री टूलकिट शामिल है। यह लाइब्रेरी बायोइनफॉरमैटिक्स क्षमताओं की एक विस्तृत श्रृंखला को कवर करती है, जिसमें ट्रांसक्रिप्शन और अनुवाद के लिए जीनोमिक अनुक्रम विश्लेषण, अनुक्रम संरेखण का प्रबंधन और जनसंख्या आनुवंशिक गणना शामिल है। यह 3D परमाणु समन्वय हेरफेर के लिए संरचनात्मक विश्लेषण टूल्स, साथ ही जीनोमिक फीचर विज़ुअलाइज़ेशन और जैव-भौगोलिक डेटा मॉडलिंग के लिए यूटिलिटीज भी प्रदान करती है। यह सिस्टम टूल रैपिंग के माध्यम से बाहरी बायोइनफॉरमैटिक्स बाइनरीज के साथ एकीकृत होता है और SQL-समर्थित अनुक्रम भंडारण के माध्यम से निरंतर जैविक रिकॉर्ड भंडारण का समर्थन करता है।
Writes structure objects to PDB files while filtering specific models, chains, residues, or atoms.
Pythonbioinformaticsbiopythondna
