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arq5x/cyvcf

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53 星标·14 分支·Python·MIT·1 次浏览

Cyvcf

A fast Python library for VCF files leveraging Cython for speed.

Features

  • Python Bioinformatics Modules - Cython-based VCF parser for improved speed.

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常见问题解答

arq5x/cyvcf 是做什么的？

A fast Python library for VCF files leveraging Cython for speed.

arq5x/cyvcf 的主要功能有哪些？

arq5x/cyvcf 的主要功能包括：Python Bioinformatics Modules。

arq5x/cyvcf 有哪些开源替代品？

arq5x/cyvcf 的开源替代品包括： biodatageeks/polars-bio — Blazing-Fast Bioinformatic Operations on Python DataFrames. brentp/cruzdb — python access to UCSC genomes database. brentp/cyvcf2 — cython + htslib == fast VCF and BCF processing. cokelaer/bioservices — Access to Biological Web Services from Python. daler/pybedtools — Python wrapper -- and more -- for BEDTools (bioinformatics tools for "genome arithmetic"). jamescasbon/pyvcf — A Variant Call Format reader for Python.