2 repository-uri
Awesome GitHub RepositoriesSequence Metadata Management
Calculates collection size and identifies extreme values within sequences to analyze data contents.
Distinguishing note: None of the candidates were relevant; this category specifically addresses sequence-based metadata analysis.
Explore 2 awesome GitHub repositories matching data & databases · Sequence Metadata Management. Refine with filters or upvote what's useful.
Awesome Sequence Metadata Management GitHub Repositories
Găsește cele mai bune repo-uri cu AI.Vom căuta cele mai potrivite repository-uri folosind AI.
- walter201230/python
walter201230/Python
26,516Vezi pe GitHubPython is a high-level, interpreted programming language designed for readability and versatility. It operates via a bytecode-based virtual machine and manages memory automatically through reference-counting garbage collection. The language supports multiple programming paradigms, including object-oriented, imperative, and functional styles, and provides a comprehensive standard library for system operations, networking, and data handling. The language is distinguished by its dynamic nature, allowing for runtime object introspection and metaclass-driven class creation. It utilizes protocol-ba
Python calculates the size, extrema, or frequency of elements within a sequence using standard utility functions and methods.
Pythonpythonpython3 - biopython/biopython
biopython/biopython
5,078Vezi pe GitHubBiopython este o bibliotecă de bioinformatică pentru Python care oferă instrumente pentru a analiza, manipula și interpreta secvențe biologice, structuri moleculare și arbori filogenetici. Servește ca un parser de secvențe biologice pentru date genomice și proteomice în mai multe formate de fișiere standard din industrie și acționează ca o interfață pentru interogarea datelor biologice și a citărilor din depozitele NCBI Entrez. Proiectul se distinge prin seturi de instrumente specializate pentru analiza structurii proteinelor și construcția arborilor filogenetici. Include un analizor de structură proteică pentru procesarea fișierelor PDB și mmCIF pentru a calcula geometria moleculară, precum și un set de instrumente pentru arbori filogenetici pentru analizarea relațiilor evolutive dintre specii. Biblioteca acoperă o gamă largă de capabilități de bioinformatică, inclusiv analiza secvențelor genomice pentru transcriere și traducere, gestionarea alinierilor de secvențe și calcule de genetică a populațiilor. Oferă, de asemenea, instrumente de analiză structurală pentru manipularea coordonatelor atomice 3D, precum și utilitare pentru vizualizarea caracteristicilor genomice și modelarea datelor biogeografice. Sistemul se integrează cu binare externe de bioinformatică prin „wrapping” și suportă stocarea persistentă a înregistrărilor biologice prin stocare de secvențe bazată pe SQL.
Attaches dictionary-based annotations and per-letter metadata, such as quality scores, to biological sequences.
Pythonbioinformaticsbiopythondna
