Awesome GitHub RepositoriesClassification Feature Engineering

Acest proiect este un toolkit Python de bio-imagistică și o suită de analiză concepută pentru procesarea și analizarea imaginilor de microscopie și medicale. Oferă o colecție de instrumente pentru cuantificarea imaginilor, segmentarea imaginilor medicale și fluxuri de lucru generale de bio-imagistică. Suita include capabilități specializate pentru cuantificarea datelor biologice, cum ar fi măsurarea complexității ramificațiilor neuronale prin analiza Sholl, calcularea distribuțiilor dimensiunilor particulelor și urmărirea zonei rănilor în scratch assays. De asemenea, dispune de o bibliotecă de segmentare a imaginilor medicale care implementează arhitecturi U-Net pentru izolarea structurilor anatomice în date 3D și folosește rețele generative adversariale (GAN) pentru a crea imagini științifice sintetice pentru augmentarea seturilor de date. În linii mari, proiectul acoperă primitive de procesare a imaginilor, inclusiv denoising, îmbunătățirea contrastului și transformări morfologice. Oferă utilitare de gestionare a seturilor de date pentru conversia adnotărilor între formatele COCO, YOLO și măști binare, precum și instrumente de machine learning pentru antrenarea rețelelor neuronale și implementarea transferului de ponderi bazat pe autoencodere. Fluxurile de lucru de analiză sunt furnizate sub formă de serie de Jupyter Notebooks interactive.