2 repositorios
Tools for combining multiple sequence alignment files into a single unified dataset.
Distinguishing note: Candidates focus on facial alignment or general text merging; this is specifically for biological alignment files (e.g., NEXUS).
Explore 2 awesome GitHub repositories matching data & databases · Sequence Alignment Merging. Refine with filters or upvote what's useful.
Biopython es una biblioteca de bioinformática para Python que proporciona herramientas para analizar, manipular y estudiar secuencias biológicas, estructuras moleculares y árboles filogenéticos. Sirve como un analizador de secuencias biológicas para datos genómicos y proteómicos en múltiples formatos de archivo estándar de la industria y actúa como interfaz para consultar datos biológicos y citas de los repositorios NCBI Entrez. El proyecto se distingue por kits de herramientas especializados para el análisis de estructuras proteicas y la construcción de árboles filogenéticos. Incluye un analizador de estructuras de proteínas para procesar archivos PDB y mmCIF para calcular la geometría molecular, así como un kit de herramientas de árboles filogenéticos para analizar relaciones evolutivas entre especies. La biblioteca cubre una amplia gama de capacidades bioinformáticas, incluyendo análisis de secuencias genómicas para transcripción y traducción, gestión de alineamientos de secuencias y cálculos de genética de poblaciones. También proporciona herramientas de análisis estructural para la manipulación de coordenadas atómicas en 3D, así como utilidades para la visualización de características genómicas y modelado de datos biogeográficos. El sistema se integra con binarios bioinformáticos externos mediante envoltorios de herramientas y admite el almacenamiento persistente de registros biológicos a través de almacenamiento de secuencias respaldado por SQL.
Combines multiple NEXUS format alignment files into a single unified dataset.
MoreLINQ is a functional programming toolkit for .NET that provides a comprehensive collection of extension methods for LINQ to Objects. It enables declarative data transformation and sequence manipulation by extending standard collection interfaces with operators that support lazy evaluation and functional composition. By leveraging the iterator pattern, the library allows for efficient, streaming-based processing of data sets while maintaining strong type safety through generic constraints. The library distinguishes itself by offering advanced capabilities for structural manipulation and co
Combines multiple sequences by applying a function to corresponding elements at each index.