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Biopython es una biblioteca de bioinformática para Python que proporciona herramientas para analizar, manipular y estudiar secuencias biológicas, estructuras moleculares y árboles filogenéticos. Sirve como un analizador de secuencias biológicas para datos genómicos y proteómicos en múltiples formatos de archivo estándar de la industria y actúa como interfaz para consultar datos biológicos y citas de los repositorios NCBI Entrez. El proyecto se distingue por kits de herramientas especializados para el análisis de estructuras proteicas y la construcción de árboles filogenéticos. Incluye un analizador de estructuras de proteínas para procesar archivos PDB y mmCIF para calcular la geometría molecular, así como un kit de herramientas de árboles filogenéticos para analizar relaciones evolutivas entre especies. La biblioteca cubre una amplia gama de capacidades bioinformáticas, incluyendo análisis de secuencias genómicas para transcripción y traducción, gestión de alineamientos de secuencias y cálculos de genética de poblaciones. También proporciona herramientas de análisis estructural para la manipulación de coordenadas atómicas en 3D, así como utilidades para la visualización de características genómicas y modelado de datos biogeográficos. El sistema se integra con binarios bioinformáticos externos mediante envoltorios de herramientas y admite el almacenamiento persistente de registros biológicos a través de almacenamiento de secuencias respaldado por SQL.