2 Repos
Awesome GitHub RepositoriesSequence Metadata Management
Calculates collection size and identifies extreme values within sequences to analyze data contents.
Distinguishing note: None of the candidates were relevant; this category specifically addresses sequence-based metadata analysis.
Explore 2 awesome GitHub repositories matching data & databases · Sequence Metadata Management. Refine with filters or upvote what's useful.
Awesome Sequence Metadata Management GitHub Repositories
Finde die besten Repos mit KI.Wir suchen mit KI nach den am besten passenden Repositories.
- walter201230/python
walter201230/Python
26,516Auf GitHub ansehenPython is a high-level, interpreted programming language designed for readability and versatility. It operates via a bytecode-based virtual machine and manages memory automatically through reference-counting garbage collection. The language supports multiple programming paradigms, including object-oriented, imperative, and functional styles, and provides a comprehensive standard library for system operations, networking, and data handling. The language is distinguished by its dynamic nature, allowing for runtime object introspection and metaclass-driven class creation. It utilizes protocol-ba
Python calculates the size, extrema, or frequency of elements within a sequence using standard utility functions and methods.
Pythonpythonpython3 - biopython/biopython
biopython/biopython
5,078Auf GitHub ansehenBiopython ist eine Bioinformatik-Bibliothek für Python, die Werkzeuge zum Parsen, Manipulieren und Analysieren biologischer Sequenzen, molekularer Strukturen und phylogenetischer Bäume bereitstellt. Sie dient als Parser für biologische Sequenzen für genomische und proteomische Daten in verschiedenen Industriestandard-Formaten und fungiert als Schnittstelle zum Abfragen biologischer Daten und Zitate aus NCBI Entrez-Repositories. Das Projekt zeichnet sich durch spezialisierte Toolkits für die Analyse von Proteinstrukturen und die Konstruktion phylogenetischer Bäume aus. Es enthält einen Proteinstruktur-Analysator zur Verarbeitung von PDB- und mmCIF-Dateien zur Berechnung der Molekulargeometrie sowie ein Toolkit für phylogenetische Bäume zur Analyse evolutionärer Beziehungen zwischen Arten. Die Bibliothek deckt ein breites Spektrum bioinformatischer Funktionen ab, einschließlich der Analyse genomischer Sequenzen für Transkription und Translation, der Verwaltung von Sequenzalignments und populationsgenetischer Berechnungen. Sie bietet zudem Tools zur strukturellen Analyse für die Manipulation von 3D-Atomkoordinaten sowie Dienstprogramme zur Visualisierung genomischer Merkmale und zur Modellierung biogeografischer Daten. Das System integriert externe Bioinformatik-Binärdateien durch Tool-Wrapping und unterstützt die persistente Speicherung biologischer Datensätze durch SQL-basierte Sequenzspeicherung.
Attaches dictionary-based annotations and per-letter metadata, such as quality scores, to biological sequences.
Pythonbioinformaticsbiopythondna
