Awesome GitHub RepositoriesSequence Metadata Management

Python is a high-level, interpreted programming language designed for readability and versatility. It operates via a bytecode-based virtual machine and manages memory automatically through reference-counting garbage collection. The language supports multiple programming paradigms, including object-oriented, imperative, and functional styles, and provides a comprehensive standard library for system operations, networking, and data handling. The language is distinguished by its dynamic nature, allowing for runtime object introspection and metaclass-driven class creation. It utilizes protocol-ba

Biopython هي مكتبة معلوماتية حيوية لـ Python توفر أدوات لتحليل ومعالجة وتحليل التسلسلات البيولوجية، والهياكل الجزيئية، والأشجار التطورية. تعمل كمحلل للتسلسلات البيولوجية للبيانات الجينومية والبروتينية عبر تنسيقات ملفات متعددة معيارية في الصناعة، وتعمل كواجهة للاستعلام عن البيانات البيولوجية والاقتباسات من مستودعات NCBI Entrez. يتميز المشروع بمجموعات أدوات متخصصة لتحليل بنية البروتين وبناء الأشجار التطورية. يتضمن محلل بنية البروتين لمعالجة ملفات PDB و mmCIF لحساب الهندسة الجزيئية، بالإضافة إلى مجموعة أدوات للأشجار التطورية لتحليل العلاقات التطورية بين الأنواع. تغطي المكتبة مجموعة واسعة من قدرات المعلوماتية الحيوية، بما في ذلك تحليل التسلسل الجينومي للنسخ والترجمة، وإدارة محاذاة التسلسلات، وحسابات الوراثة السكانية. كما توفر أدوات تحليل هيكلية لمعالجة الإحداثيات الذرية ثلاثية الأبعاد، بالإضافة إلى أدوات لتصور الميزات الجينومية ونمذجة البيانات الجغرافية الحيوية. يتكامل النظام مع ملفات المعلوماتية الحيوية الثنائية الخارجية عبر تغليف الأدوات ويدعم تخزين السجلات البيولوجية المستمرة من خلال تخزين التسلسلات المدعوم بـ SQL.