1 مستودع
Awesome GitHub RepositoriesMolecular Structure Export
Export of 3D molecular structures to formats like PDB with specific residue or atom filtering.
Distinct from Structured Data Exporters: Focuses on 3D atomic coordinate data rather than general JSON/CSV document exports.
Explore 1 awesome GitHub repository matching data & databases · Molecular Structure Export. Refine with filters or upvote what's useful.
Awesome Molecular Structure Export GitHub Repositories
اعثر على أفضل المستودعات باستخدام الذكاء الاصطناعي.سنبحث عن أفضل المستودعات المطابقة باستخدام الذكاء الاصطناعي.
- biopython/biopython
biopython/biopython
5,078عرض على GitHubBiopython هي مكتبة معلوماتية حيوية لـ Python توفر أدوات لتحليل ومعالجة وتحليل التسلسلات البيولوجية، والهياكل الجزيئية، والأشجار التطورية. تعمل كمحلل للتسلسلات البيولوجية للبيانات الجينومية والبروتينية عبر تنسيقات ملفات متعددة معيارية في الصناعة، وتعمل كواجهة للاستعلام عن البيانات البيولوجية والاقتباسات من مستودعات NCBI Entrez. يتميز المشروع بمجموعات أدوات متخصصة لتحليل بنية البروتين وبناء الأشجار التطورية. يتضمن محلل بنية البروتين لمعالجة ملفات PDB و mmCIF لحساب الهندسة الجزيئية، بالإضافة إلى مجموعة أدوات للأشجار التطورية لتحليل العلاقات التطورية بين الأنواع. تغطي المكتبة مجموعة واسعة من قدرات المعلوماتية الحيوية، بما في ذلك تحليل التسلسل الجينومي للنسخ والترجمة، وإدارة محاذاة التسلسلات، وحسابات الوراثة السكانية. كما توفر أدوات تحليل هيكلية لمعالجة الإحداثيات الذرية ثلاثية الأبعاد، بالإضافة إلى أدوات لتصور الميزات الجينومية ونمذجة البيانات الجغرافية الحيوية. يتكامل النظام مع ملفات المعلوماتية الحيوية الثنائية الخارجية عبر تغليف الأدوات ويدعم تخزين السجلات البيولوجية المستمرة من خلال تخزين التسلسلات المدعوم بـ SQL.
Writes structure objects to PDB files while filtering specific models, chains, residues, or atoms.
Pythonbioinformaticsbiopythondna
