1 مستودع
Identifying and isolating intergenic or non-coding DNA sequences within a genome.
Distinct from Genomic Sequence Interpreters: Distinct from Genomic Sequence Interpreters: focuses on the specific task of isolating intergenic regions rather than general variant interpretation.
Explore 1 awesome GitHub repository matching data & databases · Non-Coding Region Extraction. Refine with filters or upvote what's useful.
Biopython هي مكتبة معلوماتية حيوية لـ Python توفر أدوات لتحليل ومعالجة وتحليل التسلسلات البيولوجية، والهياكل الجزيئية، والأشجار التطورية. تعمل كمحلل للتسلسلات البيولوجية للبيانات الجينومية والبروتينية عبر تنسيقات ملفات متعددة معيارية في الصناعة، وتعمل كواجهة للاستعلام عن البيانات البيولوجية والاقتباسات من مستودعات NCBI Entrez. يتميز المشروع بمجموعات أدوات متخصصة لتحليل بنية البروتين وبناء الأشجار التطورية. يتضمن محلل بنية البروتين لمعالجة ملفات PDB و mmCIF لحساب الهندسة الجزيئية، بالإضافة إلى مجموعة أدوات للأشجار التطورية لتحليل العلاقات التطورية بين الأنواع. تغطي المكتبة مجموعة واسعة من قدرات المعلوماتية الحيوية، بما في ذلك تحليل التسلسل الجينومي للنسخ والترجمة، وإدارة محاذاة التسلسلات، وحسابات الوراثة السكانية. كما توفر أدوات تحليل هيكلية لمعالجة الإحداثيات الذرية ثلاثية الأبعاد، بالإضافة إلى أدوات لتصور الميزات الجينومية ونمذجة البيانات الجغرافية الحيوية. يتكامل النظام مع ملفات المعلوماتية الحيوية الثنائية الخارجية عبر تغليف الأدوات ويدعم تخزين السجلات البيولوجية المستمرة من خلال تخزين التسلسلات المدعوم بـ SQL.
Isolates non-coding DNA sequences located between genes from a larger genomic sequence.